Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC166P0CW27 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC166P0CW27 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms