Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CBX6O95503 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX6O95503 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX6O95503 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms