Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIX6O95475 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SIX6O95475 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SIX6O95475 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms