Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VAMP4O75379 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VAMP4O75379 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms