Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CTSVO60911 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms