Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRD4O60885 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRD4O60885 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD4O60885 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD4O60885 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD4O60885 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms