Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NOBOXO60393 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NOBOXO60393 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms