Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPAG9O60271 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPAG9O60271 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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