Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SYNGR2O43760 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SYNGR2O43760 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms