Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMAD6O43541 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMAD6O43541 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms