Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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HOXA3O43365 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
HOXA3O43365 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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