Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CTIFO43310 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CTIFO43310 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms