Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PLXNB1O43157 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms