Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM6BO15054 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDM6BO15054 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms