Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USP9YO00507 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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