Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
AGRNO00468 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AGRNO00468 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AGRNO00468 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms