Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC01387J3KSC0 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms