Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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