Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
E9PBE3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
E9PBE3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
E9PBE3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
E9PBE3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms