Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVV-2B6SEH9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVV-2B6SEH9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms