Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
A8MVJ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
A8MVJ9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
A8MVJ9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms