Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MEIS3P1A6NDR6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MEIS3P1A6NDR6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms