Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IRGMA1A4Y4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms