Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
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