Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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ARL2-SNX15V9GYD0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
ARL2-SNX15V9GYD0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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