Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MAP3K4Q9Y6R4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MAP3K4Q9Y6R4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms