Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNSTRNQ9Y448 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms