Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HIF3AQ9Y2N7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HIF3AQ9Y2N7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms