Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHANK2Q9UPX8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHANK2Q9UPX8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms