Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNQ0

ABCG2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG2Q9UNQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ABCG2Q9UNQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms