Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

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Length 2,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTPRQQ9UMZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRQQ9UMZ3 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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