Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GRID1Q9ULK0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRID1Q9ULK0 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms