Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PACSIN3Q9UKS6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms