Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CTNNA3Q9UI47 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTNNA3Q9UI47 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms