Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLIP2Q9UDT6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms