Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms