Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KLHL13Q9P2N7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL13Q9P2N7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms