Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRFN1Q9P244 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms