Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHRF1Q9P1Y6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHRF1Q9P1Y6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms