Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHMP5Q9NZZ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHMP5Q9NZZ3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms