Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NKIRAS1Q9NYS0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms