Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CHCHD3Q9NX63 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms