Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
C1orf109Q9NX04 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C1orf109Q9NX04 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms