Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ABCF3Q9NUQ8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms