Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KRT82Q9NSB4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.21■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRT82Q9NSB4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms