Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMPRSS4Q9NRS4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMPRSS4Q9NRS4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms