Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CLSTN2Q9H4D0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms