Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NIFKQ9BYG3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms