Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IFT27Q9BW83 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT27Q9BW83 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms