Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RIOK2Q9BVS4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms